1、防止跳出web目录
　　首先修改httpd.conf,假如您只允许您的php脚本程式在web目录里操作,还能够修改httpd.conf文档限制php的操作路径。比如您的web目录是/usr/local/apache/htdocs,那么在httpd.conf里加上这么几行：
　　php_admin_value open_basedir /usr/local/apache
/htdocs
　　这样,假如脚本要读取/usr/local/apache/htdocs以外的文档将不会被允许,假如错误显示打开的话会提示这样的错误：
　　Warning: open_basedir restriction in effect. File is in wrong directory in
　　/usr/local/apache/htdocs/open.php on line 4
　　等等。
　　2、防止php木马执行webshell
　　打开safe_mode,
　　在,php.ini中配置
　　disable_functions= passthru,exec,shell_exec,system
　　二者选一即可,也可都选
　　3、防止php木马读写文档目录
　　在php.ini中的
　　disable_functions= passthru,exec,shell_exec,system
　　后面加上php处理文档的函数
　　主要有
　　fopen,mkdir,rmdir,chmod,unlink,dir
　　fopen,fread,fclose,fwrite,file_exists
　　closedir,is_dir,readdir.opendir
　　fileperms.copy,unlink,delfile
　　即成为
　　disable_functions= passthru,exec,shell_exec,system,fopen,mkdir,rmdir,chmod,unlink,dir,fopen,fread,fclose,fwrite,file_exists,closedir,is_dir,readdir.opendir,fileperms.copy,unlink,delfile
　　ok,大功告成,php木马拿我们没辙了,遗憾的是这样的话,利用文本数据库的那些东西就都不能用了。
　　假如是在windos平台下搭建的apache我们还需要注意一点,apache默认运行是system权限,这很恐怖,这让人感觉很不爽.那我们就给apache降降权限吧。
　　net user apache fuckmicrosoft /add
　　net localgroup users apache /del
　　ok.我们建立了一个不属于任何组的用户apche。
　　我们打开电脑管理器,选服务,点apache服务的属性,我们选择log on,选择this account,我们填入上面所建立的账户和密码,重启apache服务,ok,apache运行在低权限下了。

　　实际上我们还能够通过配置各个文档夹的权限,来让apache用户只能执行我们想让他能干的事情,给每一个目录建立一个单独能读写的用户。这也是当前很多虚拟主机提供商的流行配置方法哦,但是这种方法用于防止这里就显的有点大材小用了。